Africa-Places.com перечислил около 7 университеты в Мапуту. Некоторые из лучших университеты в Мапуту являются- Университет Эдуардо Мондлане, Университет Эдуардо Мондлане, Католический университет Мозамбика - факультет медицинских наук, Католический университет Мозамбика - факультет медицинских наук, Технический университет Мозамбика, Католический университет Мозамбика - факультет медицинских наук & Университет Эдуардо Мондлане.